版本学有“涵芬楼本”一说。一般推为珍本，谓其“珍重”，不仅因其多为宋元旧刻，而且实在是“幸存”。一九三二年淞沪之变，日军炮火炸毁商务印书馆，张元济惨淡经营多年的涵芬楼亦火于一旦。幸张元济曾有预感，自一九二七年起，将部分善本移藏租界银行保险库中，但仅为总数的六分之一弱，是为涵芬楼惨祸烬余硕果仅存。后归于北京图书馆。
涵芬楼一九○四年为商务印书馆元老张元济创设之馆内藏书楼，原计划收购中国四大藏书家之一的陆氏“
张元济个人有“涉园”藏书，与涵芬楼公私分际，如井水河水。当初为涵芬楼购书时，发现有一部《宋诗钞初集》为先祖“涉园”旧藏，一时不忍释手，终因书属商务公有，不敢染指。菊老德风，于此可见。尝想今日某些读书人信奉“我的是我的，公共的也是我的”，于此心有愧感否？一九二五年涵芬楼并入东方图书馆，收藏过蒋汝藻“密韵楼”，其中有王国维费力经年所校勘过的珍籍，然一夕战火化作此恨绵绵的云烟。
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