一九六八年九月五日,新疆和西藏同时成立革命委员会,成为我国最后成立革命委员会的省级单位。这样,全国二十九个省、市、自治区都成立了革命委员会,实现了全国一片红。
西藏自治区成立了革命委员会以后,两大派的矛盾冲突仍相当严重,派性还没有完全消除。
大联指的一些人对新生的革命委员会心怀不满,有抵触情绪,他们认为军区偏袒了造总,反对军区承认错误。大联指的一些头头甚至挑动一些不明真象的群众去冲击军区,抢夺部队的武器装备,准备新的武斗。
为此,一九六九年二月十一日,中共中央、中央文革下发【关于西藏地区文化大革命应该注意的问题】。其要点如下:
“西藏自治区革命委员会是经伟大领袖毛主席、林副主席、中央、中央文革批准的。一切革命同志、革命群众组织,都必须坚决拥护,坚决执行中共中央、国务院、中央军委、中央文革一九六八年八月二十八日关于成立西藏自治区革命委员会的批示。必须坚决支持、拥护、尊重革命委员会的一元化领导,用毛泽东思想统一认识,统一政策,统一计划,统一指挥,统一行动。大联指的某些同志不尊重革委会的领导,不叁加革委会召集的会议是错误的,希望大联指这些同志顾全大局,立即改正错误,否则要犯更大的错误。
“西藏是我国反对美帝、苏修,反对印度反动派斗争的西南前线。”“西藏各族人民和一切革命群众组织都要遵守西藏革命委员会、西藏军区保卫边疆的一切规定和命令,保卫部队战备、指挥正常进行,不得冲击部队和指挥机关,拦截军车,抢夺武器和部队物资等。”
“西藏军区的平反公告和对大绍寺事件的处理是军区纠正过去支一派压一派的错误,这种作法是符合毛主席关于公开向群众承认错误,并立即改正的教导的。大联指和造总都要正确对待,不能片面理解,不能各取所需。大联指应该支持军区改正错误,要大力加强革命大联合,警惕阶级敌人利用平反公告,制造事端,挑动群众斗群众,破坏革命大联合,破坏革命委员会。
一九六八年十月,西藏两派造总和大联指自行解散组织,各地区各单位按系统、按行业、按班级实现了大联合,西藏地区局势逐渐缓和。

